台灣與香港的品牌在 Shopify 上遇到的第一個差異，往往不是設計，而是金流。兩地看起來相近，但 Shopify Payments 的可用性完全不同，這會直接影響手續費與方案選擇。
香港：可以用 Shopify Payments
香港商家可以啟用 Shopify Payments，信用卡與錢包付款直接在 Shopify 處理，不會產生第三方金流的額外手續費。Shop Pay 等與 Shopify Payments 綁定的功能也能使用。轉數快（FPS）、八達通、AlipayHK 等在地方式是否支援，取決於啟用的付款方式與金流商。
台灣：搭配第三方金流
- Shopify Payments 不開放給台灣商家，需使用 Shopify 支援的第三方金流。
- 每筆交易除了金流商費用，還有 Shopify 的額外手續費：Basic 2%、Grow 1%、Advanced 0.6%。
- Shop Pay 等綁定 Shopify Payments 的功能無法使用。
- LINE Pay、街口支付、超商代碼繳費等在地方式，要確認金流商是否支援以及串接方式。
營收變大時，額外手續費的差距會比月費差距更快決定方案。完整的預算計算請見 Shopify 架站費用。
賣到海外時的付款方式
- 美國與英國：信用卡、Apple Pay、Google Pay、PayPal。
- 日本：信用卡之外，超商付款與後付款等在地方式很重要。
- 歐洲：依國家不同，荷蘭重視 iDEAL，德國重視 PayPal 與後付款，北歐重視 Klarna。
- 東南亞：電子錢包與銀行轉帳比例高，依國家選擇。
付款方式不是越多越好。每多一種，就多一個顧客要做的決定，有些還會載入額外腳本。每個市場 3–4 種通常就足夠，之後再依數據增加。
提升結帳信任感
- 以當地幣別顯示價格（Shopify Markets）。
- 跨境訂單在結帳時就收取關稅與稅金（DDP），避免到貨時被追加費用而拒收。
- 用當地語言寫清楚退換貨政策與到貨天數。
物流與關稅的設定接續在 超商取貨與跨境物流。金流設定包含在 Shopify 商店架設 的標準範圍內。